El 12 de abril, Hernández abrió el marcador para el Manchester en la victoria 2-1 contra el Chelsea en cuartos de final en la Champions League, el juego término 3-1 en el global. El 12 de mayo anota contra el Swansea poniendo el marcador 1-0 en la despedida del técnico Alex Ferguson. El domingo 19 de mayo, el mexicano anota en el último partido como entrenador del escocés Alex Ferguson al frente del United, quedando 5-5 vs el West Bromwich. El 1 de enero de 2011; Hernández salió de la banca en The Hawthorns anotando el gol del triunfo en la victoria del Manchester United, 1-2 sobre el West Bromwich Albion. Hernández coronó su temporada de debut con el Manchester United al ganar el premio Jugador del año Sir Matt Busby el 18 de mayo, que fue votado por los fanes. Hizo su debut con el West Ham el 13 de agosto, jugando los 90 minutos en la derrota por 4-0 contra su antiguo club Manchester United en Old Trafford. El 18 de agosto de 2015 volvería a Old Trafford para el juego de ida de los plays-off contra el Club Brujas entrando en los últimos 18 minutos en la victoria 3 a 1 de su equipo.
El 25 de septiembre del 2013 anotó el primer gol de la temporada 2013-14 dentro de la Capital One Cup venciendo 1-0 al Liverpool en Old Trafford. El sábado 11 de agosto del 2012, anotó un gol en la victoria del Manchester United ante el Hannover 96 en el cierre de la pretemporada del equipo inglés de la Liga Premier. El 26 de diciembre anota el gol que le dio los tres puntos al Manchester United sobre el Newcastle United en el minuto final del partido. El 23 de abril, Javier Hernández anotó el gol de la victoria con un cabezazo en el triunfo del Manchester United 1-0 sobre el Everton. El 30 de septiembre de 2009, Javier debutó con la Selección de fútbol de México ante Colombia. Aunque su equipo fue derrotado por 2-1, Javier dio una asistencia a Paul Aguilar para la anotación del único gol de la selección mexicana.
Es el máximo goleador histórico de la selección mexicana con 52 goles. El 30 de enero de 2016, en el segundo partido de Bayer después de la pausa de invierno, anotaría doblete en la victoria por 3-0 frente al Hannover 96 para registrar sus 21 goles de la temporada. El 19 de enero anotó su segundo gol en la Premier League perdiendo 3-1 frente al Chelsea en Stamford Bridge. Anotaría su primer hat-trick en 15 minutos por la Bundesliga el 12 de diciembre en la goleada 5-0 frente al Borussia Mönchengladbach llegando a 15 goles en 12 partidos. El gol contra el «Chelsea», lo convirtió en el primer jugador desde Ruud van Nistelrooy en la temporada 2001-02 en anotar 20 goles para el club en su debut en la temporada. Pasó al Club Brujas el 29 de enero de 2016. Marcó su primer gol en su primer partido contra KVC Westerlo. Hernández Balcázar anotó su gol al minuto 47, después de que ingresara de cambio en la parte complementaria en lugar de Wayne Rooney. Anotó 5 goles, incluido un gol anotado en la victoria de 1:2 contra Burnley FC en el primer día de 2020. En ese mismo partido se lesionaría, perdiéndose parte de la temporada debido a una ruptura del ligamento cruzado.
En la jornada 11 Javier volvió a meter goles, al haber anotado un gol en la derrota de su equipo por 2-1 ante el Monterrey. Javier tiene una cláusula de contrato por 50 millones de euros. En noviembre, Hernández sufrió una lesión en el tendón de la corva mientras estaba de servicio internacional con México, y se informó que sería excluido de la actividad por hasta dos semanas. Tras el descanso, en el minuto 56, el Recreativo se encontró rápidamente con un buen cabezazo de David que se convirtió en gol. Tras el despido de Slaven Bilić y el nombramiento de David Moyes como gerente, se temía que Hernández fuera excluido en West Ham como lo estaba en el Manchester United. El 20 de noviembre logra su cuarto gol en la liga, marcando el 2-0 a favor de su equipo, en la victoria del Manchester ante el Wigan Athletic. El 8 de mayo de 2011, Hernández anota el gol más rápido de la temporada de la Premier League, a los 35 segundos de juego ante el Chelsea, juego que término 2-1 favor Manchester United. El Manchester United ganó al Chelsea 3-1, ganando la Community Shield. El 28 de julio de 2011, Rafael Ortega, el médico de Chivas, informó al Manchester United que Hernández sufría de una enfermedad neurológica preexistente.
Cuatro días después el 29 de enero, Hernández anotó su primer gol de la FA Cup para el Manchester United, cuando anotó el gol ganador en una victoria 1-2 sobre el Southampton. Hernández volvió a anotar en el siguiente juego en casa del Newcastle United, cuando un disparo de Wayne Rooney fue bloqueado por un defensa y rebotando contra su cuerpo haciendo así su sexto gol. Su primer partido disputado fue contra Tottenham Hotspur al perder 3:1 sin marcar gol. Regresó el 22 de agosto para entrar de cambio al minuto 79 de la segunda jornada en contra del Tottenham Hotspur. El 31 de agosto del 2015 se hace oficial el traspaso de Chicharito por el Bayer 04 Leverkusen en un contrato por 4 años. ↑ Agencia EFE (23 de agosto de 2011). «El Espanyol lucirá Cancún en la camiseta tres años». El 25 de enero de 2011 Hernández anotó el segundo gol de Mánchester United en la victoria 2-3 sobre Blackpool.